El Comité Técnico es el responsable tanto del establecimiento de líneas y prioridades para el desarrollo de las investigaciones, como de la coordinación y evaluación de los proyectos en ejecución.
El Comité Técnico cuenta con la participación de hasta tres representantes por cada uno de los países miembros y el CIAT.
A su vez se divide en dos: Comité Técnico para la Zona Tropical y Comité Técnico para la Zona Templada. Dichos comité se reúnen al menos una vez por año e interactuan entre sí en materia de transferencia de información e implementación de proyectos de investigación.
Los miembros del Comité Técnico del FLAR para la Zona Tropical se reúnen una vez al año, previo al Taller de Evaluación y Selección de Materiales que se realiza en Santa Rosa, Villavicencio.
Los miembros del Comité han creado otros espacios de intercambio, como el Taller Regional de Mejoramiento de Arroz, que se realiza una vez al año en diferentes países. Asimismo, y como actividades anexas a las visitas de seguimiento realizadas por el fitomejorador, los miembros locales programan giras o talleres de observación de materiales en diferentes zonas a las que están invitados a participar todos los miembros del Comité Técnico.
Este Comité Técnico se reúne una vez al año en uno de los países miembros en la Zona Templada. Generalmente la reunión sirve para compartir los resultados, avances de investigación y definir un plan de acción para el siguiente período.
